Rafael era o goleiro do Vasco no jogo que selou o rebaixamento do clube à Série B em 2008, uma derrota por 2 a 0 contra o Vitória em São Januário. Ele deixou a Colina logo depois (foi para o Fluminense) de forma conturbada, sob a alegação de que teria cometido ato de indisciplina durante a pré-temporada no Espírito Santo.
Hoje, Rafael vive em Matão (SP) com a família e está sem clube. Seu úlimo trabalho foi no Rio Verde, que acabou rebaixado no Campeonato Goiano. Aos 29 anos, está procurando um clube do Rio de Janeiro para dar seguimento à carreira. Em entrevista ao site GloboEsporte.com, Rafael falou sobre a época em que atuou no Vasco e o rebaixamento do clube:
"Foi difícil, pior coisa da carreira. Cheguei com um time em crise, e com a chegada do Renato passei a jogar, fui bem em algumas partidas. Mas no último jogo a gente sabia que seria difícil, pois não dependíamos apenas das nossas forças. Perdemos e, além disso, os outros resultados foram todos desfavoráveis. No gol da derrota, ainda cheguei a pegar na bola, mas ela sobrou em cima da linha para o atacante marcar. Lembro da torcida, dos jogadores, todos chorando", declarou Rafael.